1、生活环境不同。扇贝一般是生活在低潮线以下、水流较急、盐度较高、水质澄清的海区；生蚝一般是生长在江河与大海的交融之处，在半咸半淡的内湾线海上。

2、外形不同。扇贝的两个贝壳大多数是左右对称的；生蚝的两个贝壳大小、形状都不同，一个小而平，一个大而隆起。

3、营养不同：扇贝含有锌；生蚝含有锌以及丰富的牛磺酸。